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技術(shù)文章
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RNA和蛋白質(zhì)相互作用研究主要通過紫外交聯(lián)和免疫沉淀（CLIP）技術(shù)，但即便是目前最新的增強(qiáng)型CLIP（eCLIP）技術(shù)，在改進(jìn)了RNA片段文庫(kù)制備方法的基礎(chǔ)上，也需要4天的時(shí)間才能完成一次實(shí)驗(yàn)，而且缺乏并行處理多個(gè)RNA結(jié)合蛋白（RBP）的能力。2022年12月22日，來(lái)自加州大學(xué)圣地亞哥分校的GeneW.Yeo和KarenB.Chapman研究組合作在NatureMethods上以BriefCommunication形式發(fā)表了題為Multiplexedtranscript...
細(xì)胞通訊（intercellularcommunication）是多細(xì)胞生物維持穩(wěn)態(tài)的重要組成部分，在腫瘤發(fā)生、衰老、感染性疾病中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。細(xì)胞通訊通常分為依賴接觸的直接通訊和以可溶性因子和細(xì)胞外囊泡（extracellularvesicle,EV）的交換為基礎(chǔ)的間接通訊。目前，研究細(xì)胞通訊有一個(gè)關(guān)鍵的難點(diǎn)在于如何區(qū)分逃出核內(nèi)體（endosome）并在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)發(fā)揮功能的蛋白質(zhì)和被溶酶體降解或釋放回細(xì)胞外空間的蛋白質(zhì)。目前缺少有效地監(jiān)測(cè)和量化細(xì)胞通訊間的功能性蛋白質(zhì)交換的...
DNA不僅存儲(chǔ)遺傳序列信息，同時(shí)還有表觀修飾信息，這兩者都對(duì)我們理解生物學(xué)至關(guān)重要。通過高通量測(cè)序測(cè)定DNA堿基G、C、T和A序列的方法已經(jīng)比較成熟，近年來(lái)針對(duì)DNA中的表觀遺傳信息的檢測(cè)方法也有了很大的進(jìn)展，比如通過堿基轉(zhuǎn)換的方法區(qū)分未修飾的C與修飾的5-甲基胞嘧啶(5mC)或5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)。這些方法包括基于亞硫酸氫鹽的方法，如全基因組亞硫酸氫鹽測(cè)序(WGBS)和無(wú)亞硫酸氫鹽方法，如酶甲基測(cè)序(EM-seq)和TET輔助的吡啶硼烷測(cè)序等。但是目前的DNA測(cè)序方...
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